- · 《世界最新医学信息文摘[05/29]
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医学信息学与生物信息学发展状况分析——基于(2)
作者:网站采编关键词:
摘要：图2 2000—2016年国外两门学科发文量 3 国内外学科文献主要来源期刊分析 分析国内外生物信息学和医学信息学科论文的来源期刊，有助于确定其领域的核心
图2 2000—2016年国外两门学科发文量
3 国内外学科文献主要来源期刊分析
分析国内外生物信息学和医学信息学科论文的来源期刊，有助于确定其领域的核心期刊，并对读者的投稿方向加以指引。
3.1 《医学信息学杂志》杂志
在中国知网中文数据库中检索《医学信息学杂志》，按关键字“医学信息”索引，时间跨度限定2000—2016年，检索内容在（表1）示出。分析（表1）中《医学信息学杂志》部分，从被引频次最高的10篇文献可以发现，此杂志收录文献主要涉及医学信息学（medical informatics）、数据科学（data science）、信息管理（information management）、医学（medicine）等方面。指明了学科研究重点，同时体现医学信息学多学科交叉的特点。
3.2 《生物信息学》杂志
在《生物信息学》杂志中，用上文同样方式按关键字“生物信息”检索，内容见（表1）。分析杂志收录文献可以看出，我国生物信息学在后基因组时代下，研究重点放在利用计算机科学进行具体数据分析，基因组学、蛋白质组学的应用以及克隆等，多个学科交叉协作，共同推动生物信息学的快速成长与进步。
3.3 外文核心杂志
以Web of Science为数据来源，“General Search”检索框分别输入“BMC Bioinformatics”（BMC生物信息学）、“Journal of Biomedical Informatics”（生物医学信息学杂志）、“Briefings in Bioinformatics”（生物信息学简报）和“Scientific Reports”（科学报告），采用“出版物名称”检索项，检索出四种不同的杂志，时间跨度限定2000—2016年。在所得检索结果中选取“研究方向”字段进行分析。
文献的研究方向代表了国外学者的最新学术研究动向。（表2）展示四种主要外文杂志收录文献共同的研究方向及其所占比例，同时还可得出每个杂志不同的学科侧重点。其中，“biochemistry molecular biology”和“computer science”综合比例最高，说明计算机技术在生物信息学研究中起到越来越重要的作用。
结合分析发现，随着算法产生数据量的爆发式增长，国外学者开始利用大数据解决相关生物学、医学问题。其中一种手段即机器学习。由于大数据具有高维、多变、复杂等特性，如何从真实、复杂、凌乱和无模式的大数据中挖掘出人类感兴趣和有价值的知识，仍需要更先进和成熟的机器学习与深度学习理论进行指导[4]。当下热门的机器学习即用数据或以往的经验，优化计算机程序的性能标准，使用机器学习方法统计生物医学方面大数据，并应用于个性化医疗、转化医疗和医学诊断，将是一种更加有效的研究途径。
4 国内外研究发展对比分析
综合国内外文献，生物信息学均以直线增长趋势不断向前发展，国外文献量多于国内近一倍，但国内发展紧跟国际，国内学者不断向国外学者学习和借鉴，努力缩小发展差距。2006年以后国内医学信息学文献量反超国外，并一直保持增长趋势。这说明在我国医学信息学研究同样得到各研究院、高校的重视，医学信息学发展基础条件已经成熟。但学科仍处于初期发展阶段，社会普及度不高，学科内部结构较混乱，科研和教育力度还远不及国外水平。
从国内外期刊收录文献可以看出，目前国内和国外生物医学领域研究均围绕基因组学、测序算法、医学、大数据分析等方面，这将促进国内和国外学者的科研合作与深层次学术交流，共同攻坚克难。但国外学者相比国内更着重于利用计算机技术和大数据科学进行序列分析、算法实现等理论研究，对于先进的机器学习方法早已开始应用。而国内倾向于应用计算机技术解决基因克隆、医学成像、水稻杂交等生物医学领域的具体问题。不可否认国内学科发展水平落后于国外，这与我国科技发展水平、教育普及程度和政府支持力度有一定关系。因此，不断加强学科领域的实践探索与理论研究，增强国际影响力，仍然任重而道远[5]。
表2 四种杂志共同研究方向所占比例统计（%）注：biochemistry molecular biology：生物化学与分子生物学；computer science：计算机科学；mathematical computational biology：数学计算生物学；genetics heredity：遗传；medical informatics：医学信息学；cell biology：细胞生物学；mathematics：数学；information science library science：信息科学图书馆学序号 研究方向 “BMC Bioinformatics” “Journal of Biomedical Informatics”“Scientific Reports”1 biochemistry molecular biology 98.47 - 88.29 38.87 2 computer science 61.63 98.79 44.15 -3 mathematical computational biology 97.75 89.12 82.59 -4 genetics heredity 77.35 - 68.50 30.57 5 medical informatics 32.12 97.46 32.75 -6 cell biology 21.31 - 8.71 15.86 7 mathematics 59.90 44.50 33.99 -8 information science library science - 50.30 20.10 -“Briefings in Bioinformatics”
文章来源：《世界最新医学信息文摘》 网址: http://www.sjzxyxxxwz.cn/qikandaodu/2020/0825/520.html